uhh das ist schon mal schlecht ... hast sonst nicht nen Brenner da (evtl. USB boot Motherboard), Windows kriegt man ja auch noch so im Netz (ist na klar auch die gefahr einer Infektion, kann man aber evtl. auch mit der Avira Live CD checken). Sonst kannst dir nie ganz sicher sein das nicht doch was im hintergrund läuft.

Sicher deine Daten und mach min. 2 Partitionen auf deine Platte, 1 x System und 1 x Daten. Mit regelmässigen System, Registrybackups, Systemlistings, einer LiveCD und UltraCompare kannst du diese vergleichen um Viren oder sogar Rootkits manuell aufzuspüren und löschen.
Wenn du so circa weisst welche Datei für die infektion verantwortlich ist, könnte das einem auch noch nee ganze ecke weiter bringen.

Mach dich auch mal in sachen VM schlau ... um das nächste mal besser vor zu beugen.