Meine Empfehlung:

PHP 5.3 und MySQL 5.1. Das umfassende Handbuch - Das Buch von Galileo Computing

Allerdings kommt im Juni eine überarbeitete Auflage in Bezug zu MySQL 5.4 heraus:

PHP 5.3 und MySQL 5.4. Das umfassende Handbuch - Das Buch von Galileo Computing