Öhm, mir fällt auf Anhieb ein, dass du einen Stick aushängen solltest (umount).
Je nachdem wie dein Stick gemountet wurde, schreibt er synchron oder asynchron (sollte sich dann auch in der Schreibgeschwindigkeit bemerkbar machen).

Teste das verhalten am besten einmal, wenn du den Stick vorher aushängst.

http://linux.die.net/man/8/mount
Hier mal noch die man Page von mount, hierzu kurz nach sync und async suchen.

mfg