Was mir grade noch einfällt: Lasse keinen Prozess, der es nicht unbedingt braucht, als root laufen. Erstelle hierfür einzelne Benutzer, da diese mit eingeschränkten Rechten arbeiten.

Probiere einfach mal ein bisschen rum - wenn gar nichts mehr geht, installierst du den Server über die Weboberfläche neu.